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【外国人個人向け】日本で働く非居住者の給与課税実務|源泉徴収と実務対応

2026年1月3日 by
Liying Huang
はじめに

グローバル人材の流動化が進む中、日本で短期就労・役員就任・不動産保有などを行う外国人や海外居住者にとって、「非居住者」としての日本の個人所得税の理解は不可欠である。

日本の所得税制度は、居住者・非居住者の区分によって課税範囲、税率、申告義務が大きく異なり、誤った理解は過少申告や源泉徴収漏れといった税務リスクにつながる。

本稿では、日本の非居住者個人に対する所得税の基本的な枠組みを整理し、実務上特に問題となりやすい論点について、国際税務の観点から解説する。


1. 非居住者の定義と判定基準

日本の所得税法において、個人は「居住者」または「非居住者」に区分される。

居住者とは、日本に住所を有する者、または現在まで引き続き1年以上居所を有する者を指し、これに該当しない個人が非居住者である。

実務上重要なのは、国籍ではなく「生活の本拠」がどこにあるかという事実認定である。短期滞在者であっても、家族帯同、職務内容、滞在目的などにより居住者と判断される場合がある。一方、長期間日本に滞在していても、明確に海外に生活の本拠がある場合は非居住者とされることもある。

この居住区分は、課税範囲を決定する最も重要な前提条件である。


2. 非居住者に対する課税範囲の基本構造

非居住者に対して日本で課税されるのは、「国内源泉所得」に限定される。

海外源泉所得は、日本では原則として課税対象外である点が、居住者との大きな違いである。

国内源泉所得には、日本国内で行われた労務に基づく給与、日本の不動産から生じる賃貸収入、日本法人から支払われる役員報酬や配当、利子、ロイヤルティなどが含まれる。

一方で、報酬の支払地が日本であっても、実際の労務提供が海外で行われている場合には、日本源泉に該当しないケースもあり、形式だけで判断することは危険である。


3. 給与所得・報酬に関する実務上の留意点

非居住者が日本で勤務した場合、その勤務日数に対応する給与部分が日本の課税対象となる。

いわゆる「日割計算」による源泉区分が必要となり、海外勤務分と日本勤務分を明確に区分できる記録の整備が求められる。

また、日本法人の役員に就任している非居住者については、役員報酬が原則として国内源泉所得とされる点に注意が必要である。実際の職務執行場所や報酬決定プロセスによっては、租税条約上の役員条項が適用される場合もあり、条約適用可否の検討が不可欠である。


4. 源泉徴収制度と税率の概要

非居住者に対する日本の所得税は、多くの場合、支払時点での源泉徴収により完結する。

給与・報酬・利子・配当・使用料などについては、原則として20.42%(復興特別所得税含む)の税率で源泉徴収される。

この源泉徴収は「分離課税」であり、原則として年末調整は行われず、確定申告も不要となる。ただし、不動産所得など一部の所得については申告が必要となる場合があるため、一律に「申告不要」と判断することはできない。


5. 租税条約による軽減・免除の可能性

日本が締結している租税条約により、国内法上課税される所得であっても、課税が軽減または免除される場合がある。

代表的なものとして、短期滞在者免税、役員報酬条項、利子・配当・ロイヤルティの軽減税率などが挙げられる。

条約適用を受けるためには、原則として事前または事後に所定の届出書(租税条約に関する届出書)の提出が必要であり、形式要件を満たさない場合は軽減が否認されるリスクがある。


6. 確定申告義務が生じるケース

非居住者であっても、すべての税務関係が源泉徴収で完結するわけではない。

日本国内の不動産所得、事業所得、複数の源泉所得がある場合などでは、確定申告が必要となることがある。

また、源泉徴収がなされていない場合や、条約適用により税額調整を行う場合にも、申告が実務上求められるケースがある。


7. 実務対応におけるリスクと専門家関与の重要性

非居住者課税は、所得区分、源泉地判定、条約適用の可否など、事実関係と法解釈が密接に絡み合う分野である。

企業側の源泉徴収漏れは、税務調査において過去分を遡及して指摘されるリスクが高く、ペナルティの対象となり得る。

そのため、非居住者個人本人だけでなく、報酬を支払う日本企業側も含め、国際税務に精通した専門家の関与が不可欠である。


まとめ

日本の非居住者個人に対する所得税は、「居住区分」「国内源泉所得」「源泉徴収」「租税条約」という四つの軸で整理することができる。

形式的な理解にとどまらず、実態に即した判定と文書化を行うことが、税務リスクを最小化する鍵となる。

非居住者が関与する取引や人事異動が増加する現在、早期の専門家相談と適切な税務設計が、企業・個人双方にとって不可欠である。

Liying Huang 2026年1月3日
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